為了滿足小型沼氣脫硫塔程序中對沼氣濕度的要求，對高、中溫的沼氣溫度進行適量降溫，采用旋風式脫水法，將沼氣中的部分水蒸氣脫除。
液封還可以達到防止氣體泄漏的目的，而且它的密封效果極佳，甚至比閥門還要嚴密。例如煤氣柜通常用水來封住，以防止煤氣泄漏。小型沼氣脫硫塔是通過水的壓力來實現防回火回氣功能的，水面高出進口的高度不能低于操作壓力的1.5倍。同時水位不能過高，不然容易引起放散管道內憋壓。一般設置水位自動調節系統，罐體上部剩余空間盡量留少，水封附件有液位計和補充水線、置換管線。
小型沼氣脫硫塔注意事項：
1、大容積的儲氣罐中含水率較高或脫水周期短的儲氣罐建議適當增加脫水罐的數量。
2、沼氣凈化裝置定期清除脫水罐內沉淀物，確保脫水罐的正常工作。
3、脫水罐運行時應注意排氣，避免出現氣阻影響脫水器正常工作。